所有中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染都應(yīng)作為結(jié)核性腦膜炎的鑒別診斷加以考慮，其中特別是真菌性腦膜炎，治療不全的細(xì)菌性腦膜炎，病毒性腦膜炎和病毒性腦炎等更易于結(jié)核性腦膜炎混淆。腦脊液中檢出隱球菌抗原或陽(yáng)性墨汁染色對(duì)診斷新型隱球菌腦膜炎極為敏感又有特異性。測(cè)定凝集試驗(yàn)，乳膠補(bǔ)體結(jié)核試驗(yàn)和對(duì)流免疫電泳皆有助于確定治療不全的細(xì)菌性腦膜炎?！　?/p>

    病毒性腦膜炎的腦脊液蛋白增高罕有超過(guò)200mg/dl，而95%的病例腦脊液糖濃度正常，一小部分病例的糖濃度也只是輕微減低；腦脊液中的白細(xì)胞也從以多形核細(xì)胞為主在24小時(shí)內(nèi)迅速轉(zhuǎn)變?yōu)橐粤馨图?xì)胞為主。病毒性腦炎腦脊液的糖濃度一般在正常范圍。個(gè)別病例可輕度降低?！　?/p>

    其他需要考慮的鑒別診斷有：癌性腦膜炎，急性梅毒性腦膜炎，特別是不完全治療的病例，弓形蟲病和豬囊蟲病，李司忒菌（Listeria）腦膜炎，中樞神經(jīng)系統(tǒng)類肉瘤，白塞（Behcet）病，紅斑狼瘡，肉芽腫性CNS血管炎和感染性心內(nèi)膜炎造成腦膜炎。