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Nature:像海綿一樣的非編碼RNA

2014-05-21 22:40 閱讀:1110 來源:ebiotrade 責(zé)任編輯:潘樂樂
[導(dǎo)讀] 一種稱為 RsmZ 的小分子 RNA 具有特殊的功能:屏蔽細(xì)菌中抑制翻譯的蛋白的作用,最新一項(xiàng)研究揭示了這種 RNA 如何能完成其功能的分子機(jī)制,指出 RsmZ 像海綿一樣能吸收多種阻遏蛋白(repressor proteins)。這一研究成果公布在5月14日的Nature雜志上。

    一種稱為 RsmZ 的小分子 RNA 具有特殊的功能:屏蔽細(xì)菌中抑制翻譯的蛋白的作用,最新一項(xiàng)研究揭示了這種 RNA 如何能完成其功能的分子機(jī)制,指出 RsmZ 像海綿一樣能吸收多種阻遏蛋白(repressor proteins)。這一研究成果公布在5月14日的Nature雜志上。

    小 RNA (small RNAs 或 sRNAs )是一類長度為40-400個(gè)核苷酸的非編碼 RNA 分子,廣泛存在于從細(xì)菌到哺乳動(dòng)物等多種不同的生物體內(nèi),執(zhí)行多種生物學(xué)功能,如 mRNA 分子的翻譯抑制、降解斷裂等。

    在熒光假單胞桿菌 Pseudomonas fluorescens CHA0 中存在RsmA 和 RsmE 兩個(gè)小分子阻遏蛋白,它們通過與目標(biāo)基因 mRNA 的核糖體結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合,達(dá)到阻礙蛋白合成的效果;小 RNA 因子 RsmX、RsmY 和 RsmZ 則競爭性結(jié)合 RsmA 和 RsmE,釋放 mRNA 的核糖體結(jié)合位點(diǎn),從而促進(jìn)其翻譯。

    之前的研究表明這些Rsm分子具有特殊的作用,但是其具體的結(jié)構(gòu)分子機(jī)制還并不清楚。在這篇文章中,研究人員利用一種特殊的操作指南,結(jié)合核磁共振(NMR)等方法,解析了 RsmZ 的分子結(jié)構(gòu),為深入了解相關(guān)作用機(jī)制鋪平了道路。

    相對于蛋白, RNA 和 RNA -蛋白結(jié)合復(fù)合物的結(jié)構(gòu)更加難以***,在這項(xiàng)研究中,來自蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的研究人員采用了一種來自Nature Communications論文的詳細(xì)操作指南方法,并結(jié)合核磁共振(NMR)和電子順磁共振波普(electron paramagnetic resonance spectroscopy,EPRS)方法,確定了這一復(fù)合物的結(jié)構(gòu)。

    這是一個(gè)“非常強(qiáng)大”的工具,杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)教授Hashim Al-Hashimi表示(他未參與該項(xiàng)研究)。電子順磁共振波譜,又稱作電子自旋共振,是由不配對電子的磁矩發(fā)源的一種磁共振技術(shù),可用于從定性和定量方面檢測物質(zhì)原子或分子中所含的不配對電子,并探索其周圍環(huán)境的結(jié)構(gòu)特性。電子順磁共振波譜儀主要由微波發(fā)生與傳導(dǎo)系統(tǒng)、諧振腔系統(tǒng)、電磁鐵系統(tǒng)以及調(diào)制和檢測系統(tǒng)四個(gè)部分組成。

    在這項(xiàng)研究中,研究人員利用核磁共振確定了結(jié)合在一個(gè)單阻遏蛋白上的 RNA 分子結(jié)構(gòu),并同時(shí)采用電子順磁共振波譜技術(shù),確定了復(fù)合物的結(jié)構(gòu),這一結(jié)構(gòu)***了 RNA 如何與不同的阻遏蛋白相互作用的。

    “ RNA -蛋白結(jié)合是一種合作狀態(tài)——一個(gè)二聚體誘導(dǎo)改變 RNA 的結(jié)構(gòu),從而促進(jìn)后續(xù)二聚體的結(jié)合”。


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