作為全球知名的華人科學家,鄧興旺教授今年上半年新當選為美國國家科學院院士,同時其研究組也獲得了不少重要的新成果,如去年年初他曾與清華大學施一公教授等共同解析了植物擬南芥感受紫外線B波段光受體UVR8的晶體結構.近期鄧興旺教授研究組又接連發(fā)表PNAS等雜志論文,取得了擬南芥UV-B光信號轉導,以及水稻高密度SNP基因分型研究新成果.

　　第一篇文章:A High Density SNP Genotyping Array for Rice Biology and Molecular Breeding由鄧興旺教授,張啟發(fā)教授等人合作完成,分析測評了一種高密度SNP基因分型芯片分析技術,指出這種技術未來將會在功能基因組研究和分子育種中發(fā)揮重要作用.

　　高密度單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析對于遺傳學家和分子育種學家來說十分重要,隨著大量的基因組測序數據,以及精確SNP檢測技術的積累發(fā)展,目前已經實現(xiàn)了水稻高質量高密度SNP芯片分析.

　　在這篇文章中,研究人員報道了一種高密度水稻SNP芯片分析及其應用的發(fā)展.他們通過篩選來自801種水稻品種重測序數據中超過1000萬個SNP位點,利用Illumina的Infinium平臺中一種稱為RiceSNP50的芯片進行分析.這種芯片共有51,478個均勻分布的標記,其中68%存在于基因區(qū)域內.

　　實驗結果表明芯片基因分型準確率高,應用方面廣泛,比如可以用于高分辨率收集優(yōu)質水稻品種核心種質.同時研究人員通過全基因組關聯(lián)研究(GWAS)也準確識別出了一個特征QTL.此外,這一芯片也被成功地用于多種驗證和特質分析過程.

　　這些研究結果表明RiceSNP50是一種精確高通量基因分型工具,未來將會在功能基因組研究和分子育種中發(fā)揮重要作用.