美國(guó)轉(zhuǎn)化基因組研究院（TGen）的研究人員通過(guò)全基因組測(cè)序，在轉(zhuǎn)移性三陰性乳腺癌（T**）中發(fā)現(xiàn)了之前未曾報(bào)道過(guò)的突變。這篇文章發(fā)表在近期的《Molecular Cancer Therapeutics》上。

　　三陰性乳腺癌是指雌激素受體（ER）、孕激素受體（PR）和人表皮生長(zhǎng)因子受體（HER2）均呈陰性的一種特殊類型乳腺癌。在西方人群中，三陰性乳腺癌占全部乳腺癌的10%-15%，尤以非洲裔人群多見(jiàn)。來(lái)自亞洲的報(bào)告顯示，三陰性乳腺癌發(fā)病率為7%-19%，與白種人相差不多。這種疾病本身具有較高的侵襲性，術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)高，且缺乏內(nèi)分泌治療，抗HER2靶向治療的機(jī)會(huì)。

　　領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是TGen的高級(jí)研究員、綜合癌癥基因組學(xué)部主任John Carpten。近年來(lái)，Carpten博士領(lǐng)導(dǎo)的研究小組利用新一代測(cè)序技術(shù)，對(duì)多個(gè)腫瘤開(kāi)展了深入的基因組學(xué)圖譜分析，包括前列腺癌、鼻咽癌、三陰性乳腺癌和結(jié)腸癌等。在這項(xiàng)研究中，Life Technologies公司也給予了支持。

　　研究小組利用Life Tech的SOLiD 4平臺(tái)對(duì)來(lái)自不同族裔的轉(zhuǎn)移性T**患者的14個(gè)腫瘤樣本進(jìn)行了分析，在十幾個(gè)基因中發(fā)現(xiàn)了明顯的突變及其他改變。這些腫瘤中突變最頻繁的基因是TP53腫瘤抑制基因，14個(gè)腫瘤中的7個(gè)有突變。而在兩名非洲裔美國(guó)人身上，也檢測(cè)到另一個(gè)腫瘤抑制基因CTNNA1的異常。ERBB4基因也有改變，此基因參與了懷孕和哺乳期間的乳腺腺體成熟，但之前從未與轉(zhuǎn)移性T**相關(guān)聯(lián)。

　　研究還包含了“異常值分析”，評(píng)估了每個(gè)腫瘤的表達(dá)模式，并與研究中的其他腫瘤進(jìn)行比較。在研究的隊(duì)列入群中過(guò)表達(dá)的癌基因有：ALK, AR, ARAF, BRAF, FGFR2, GLI1, GLI2, HRAS, HSP90AA1, KRAS, MET, NOTCH2, NOTCH3和SHH。表達(dá)明顯降低的癌基因有：BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CTNNA1, DKK1, FBXW7, NF1, PTEN和SFN。

　　每個(gè)腫瘤在基因組上都是獨(dú)特的，但在14個(gè)腫瘤中，有9個(gè)都包含了特定細(xì)胞通路的改變：RAS/RAF/MEK/ERK和PI3K/AKT/MTOR，有的是一條改變，有的是兩條都改變。

　　作者認(rèn)為，轉(zhuǎn)移性T**的全基因組和轉(zhuǎn)錄組分析讓人們深入了解了這種癌癥的體細(xì)胞事件。這些基因組數(shù)具有望指導(dǎo)患者參與研究性的治療試驗(yàn)，并為未來(lái)試驗(yàn)提供假設(shè)。

　　Life Technologies公司的首席醫(yī)療官Paul Billings博士表示：“研究強(qiáng)調(diào)了基因組測(cè)序在改善癌癥治療上的潛在臨床價(jià)值。我們希望在不遠(yuǎn)的將來(lái)，更多患者和醫(yī)生能夠用到測(cè)序?；蚪M測(cè)序最終將成為腫瘤科醫(yī)生的標(biāo)準(zhǔn)工具，讓他們能夠?yàn)槊课换颊叨壬矶ㄖ漂煼ā?rdquo;